Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SlkO54988 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SlkO54988 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlkO54988 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlkO54988 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlkO54988 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlkO54988 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SlkO54988 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms