Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf13O54965 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf13O54965 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf13O54965 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf13O54965 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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