Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms