Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk1O54908 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk1O54908 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk1O54908 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk1O54908 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk1O54908 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk1O54908 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dkk1O54908 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk1O54908 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk1O54908 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk1O54908 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk1O54908 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk1O54908 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dkk1O54908 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dkk1O54908 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms