Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp10aO54827 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp10aO54827 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms