Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gp1baO35930 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms