Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm2O35900 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms