Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NudcO35685 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NudcO35685 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NudcO35685 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NudcO35685 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NudcO35685 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NudcO35685 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NudcO35685 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NudcO35685 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NudcO35685 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NudcO35685 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NudcO35685 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NudcO35685 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NudcO35685 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NudcO35685 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NudcO35685 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms