Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1mwO35599 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1mwO35599 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms