Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Clk4O35493 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Clk4O35493 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Clk4O35493 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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