Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms