Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrt1O35449 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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