Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ColqO35348 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ColqO35348 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ColqO35348 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ColqO35348 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ColqO35348 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ColqO35348 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms