Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Kpna4O35343 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Kpna4O35343 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Kpna4O35343 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Kpna4O35343 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna4O35343 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms