Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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