Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnk3O35111 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Kcnk3O35111 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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