Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ArxO35085 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ArxO35085 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ArxO35085 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ArxO35085 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ArxO35085 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ArxO35085 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ArxO35085 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ArxO35085 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms