Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sypl1O09117 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sypl1O09117 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms