Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LfngO09010 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LfngO09010 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LfngO09010 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LfngO09010 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LfngO09010 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LfngO09010 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LfngO09010 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LfngO09010 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms