Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps1O08983 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps1O08983 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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