Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efna4O08542 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms