Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MsmbO08540 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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