Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17078M0QW51 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17078M0QW51 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17078M0QW51 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms