Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8888J3QPX5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms