Protein–RNA interactions for Protein: J3QNT6

Gm5039, Predicted gene 5039, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5039J3QNT6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5039J3QNT6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5039J3QNT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms