Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21976J3QNN2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21976J3QNN2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms