Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200cJ3QK46 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200cJ3QK46 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms