Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21863J3KMP8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm21863J3KMP8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21863J3KMP8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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