Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20696H3BJN7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20696H3BJN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms