Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm29394H3BIW7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm29394H3BIW7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms