Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4bG5E8Z2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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