Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfgef1G3X9K3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms