Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc9a3G3X939 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc9a3G3X939 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms