Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34aG3UW52 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms