Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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