Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28038F7BCN9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Gm28038F7BCN9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm28038F7BCN9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Gm28038F7BCN9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28038F7BCN9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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