Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm5861F6VCN9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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