Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933403O08RikF6UK53 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933403O08RikF6UK53 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms