Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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