Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms