Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm29094F6Q785 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm29094F6Q785 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms