Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms