Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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