Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc146E9Q9F7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc146E9Q9F7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms