Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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