Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2237E9Q501 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2237E9Q501 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms