Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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