Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CenpfE9Q3P4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CenpfE9Q3P4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms