Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms