Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms